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2023

CDPI3 MGB

来源：

长沙瀚辰生物科技有限公司

　　CDPI3 MGB

CDPI3 MGB介绍

　　CDPI3(图1)是从天然产物CC-1065中衍生出来的一种新月形分子，结构中的小槽具有很强的DNA结合特性，CDPI3占据双链DNA大约5个碱基长度的区域，MGB和槽底之间是通过疏水作用和范德华力相互作用进行的可逆结合。

　　 图1: CDPI3结构

　　带有共轭MGB基团的DNA探针与单链DNA靶标形成极其稳定的双链，允许更短的探针用于杂交分析。与未修饰的DNA相比，MGB探针具有更高的熔化温度(Tm)和更高的特异性，特别是当错配发生在双螺旋的MGB区域时。因此，MGB探针可以明显短于传统探针，具备更好的序列识别和灵活性。

　　MGB探针设计最简单的方法是使用MGB载体，添加一个淬灭剂分子作为第一个添加物，并用5'-荧光团完成合成。另一种方法是，荧光团载体可与含有淬灭剂分子的5'端一起使用，随后在5'端添加最终MGB。

　　CDPI3 MGB脱保护

　　DNA合成周期中的碘氧化步骤有可能破坏次要碱基和修饰剂，因此，当在合成过程中使用标准的0.02 M碘氧化剂时，发现CDPI3 MGB CPG的吲哚残基易被碘化，这只在CDPI3 MGB CPG中观察到，5'-CDPI3 MGB亚磷酰胺的吲哚环的氮上缺乏乙氧羰基保护基团。

　　图2为5'-T8-CDPI3 MGB-3'色谱图，色谱图1)和2)是在30%氢氧化铵中室温脱保护2小时，1)中寡核苷酸低聚物采用0.5 M CSO无碘氧化，氧化时间为3 min;2)中寡核苷酸低聚物采用0.02 M碘氧化剂;3)中寡核苷酸低聚物在55°C的乙醇/NH4OH 1:3 (v/v)条件下脱保护17小时后，其碘化是可逆的。

　　 图2: 5’-T8-CDPI3 MGB-3'色谱图

　　长沙瀚辰生物科技有限公司专注于IVD上游原材料供应，可提供小沟结合物5'-CDPI3亚磷酰胺(等同5'-CDPI3 MGB Phosphoramidite)、小沟结合物CDPI3-CPG(1000Å)(等同CDPI3 MGB CPG(1000Å))等荧光染料，此外我司还可提供化学发光产品及单分散PEG等产品。

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　　小沟结合物5'-CDPI3亚磷酰胺(等同5'-CDPI3 MGB Phosphoramidite)

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CDPI3 MGB